Ressources (calcul, stockage)

 

Le plateau bioinformatique possède des ressources de calcul et de stockage pour son activité, mais se repose aussi sur les plateformes bioinformatiques de l'INRAE.
Si vous avez besoin de moyens de stockage et de calcul pour vos projets et activités de recherches, vous pouvez nous demander conseil.

Voici quelques instructions pour démarrer :
  • Nous vous recommandons de nous confier vos données génomiques brutes pour un stockage pérenne (et au besoin, un accès depuis le serveur genologin).
  • Si vous avez besoin d'un accès à un cluster de calcul, nous vous recommandons de demander un compte à genobioinfo, en précisant que vous êtes rattaché au département SPE, et à l'UMR1290 BIOGER.

Attention, si vous n'avez jamais utilisé un cluster de calcul, il faut savoir que vous n'avez pas le droit de lancer des commandes frontales sur le serveur. Lisez bien la documentation pour lancer des job slurm.
En cas de doute ou si besoin de conseils, nous demander.

  • Si vous souhaitez utiliser une interface web galaxy pour vos analyses, nous vous recommandons d'utiliser l'interface générique usegalaxy (il faut vous créer un compte).