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BIOGER

BIOGER

L'unité de recherche BIOGER (BIOlogie des champignons phytopathogènes : des GEnomes aux agRo-écosystèmes) de l'INRAE est un pôle de référence français pour la recherche sur les maladies fongiques des grandes cultures en Europe (blé, colza et, dans une moindre mesure, vigne).

BIOGER fait partie du Centre INRAE Versailles-Saclay et, depuis octobre 2022, elle se situe sur le Campus Agro Paris-Saclay. L'unité est rattachée au département INRAE Santé des Plantes et Environnement (SPE) (intranet SPE ici >>>).

BIOGER développe des approches pluridisciplinaires (génomique, biologie moléculaire et biochimie, biologie cellulaire, génétique, génétique des populations, évolution, épidémiologie, modélisation, phénotypage, diagnostic et taxonomie) et multi-échelles (du gène au paysage).
Nos modèles d'étude sont des agents pathogènes responsables de maladies fongiques d'importance économique majeure. Ils comprennent les rouilles du blé (Puccinia striiformis et Puccinia triticina), Zymoseptoria tritici (septoriose du blé), Leptosphaeria maculans (nécrose du collet du colza), et des agents pathogènes généralistes que sont Botrytis cinerea (pourriture grise) et des espèces de Colletotrichum (anthracnose).
Les travaux de BIOGER et de nos collaborateurs ont contribué à élever ces espèces fongiques au rang de modèles pour certains aspects de leurs traits génomiques, biologiques, écologiques ou adaptatifs.

Nos travaux s'articulent autour de quatre grands thèmes de recherche intégrés :
1. Biologie et modes de vie des champignons pathogènes
2. Mécanismes d'interactions au sein de l'écosystème de la plante hôte
3. Adaptation des champignons phytopathogènes
4. Gestion durable des maladies fongiques

Ces thèmes sont développés par cinq équipes de recherche, avec l’appui de deux plateformes techniques et des services communs :

ADEP – Processus adaptatifs et épidémiologiques des interactions blé-champignons phytopathogènes
BioSysCo – Biologie des Populations dans les Systemes sous contraintes
ECCP – Effectors of Communication at the fungal Plant interface
EPLM – Effecteurs et Pathogenèse chez Leptosphaeria maculans
GAIA – Gestion et Anticipation Intégrées de l’Adaptation des champignons phytopathogènes

Plateformes techniques : BioInfoBIOGER, IMAFUN

Services communs : Administration , Service informatique, Laverie, Serres

Nos recherches, à la fois fondamentales et appliquées, ont donc pour objectif global de répondre aux attentes sociétales en termes de lutte durable et respectueuse de l'environnement contre les maladies fongiques des plantes de grande culture et de gestion des risques liés à la dissémination et au potentiel adaptatif des champignons phytopathogènes.

Agenda des séminaires

Sauf mention contraire, les séminaires ont lieu le lundi à 13h45 en salle F3.506.
  • Lundi 26 mai : Léa Soucq (équipe EPLM)
  • Lundi 2 juin : préparation des candidats au concours de l'ED
  • Mardi 3 Juin, 11h : "How Breeders Have (and Occasionally Haven't) Achieved Durable Disease Resistance in Cereals"- James Brown (JIC, Norwich, UK).
  • Lundi 16 juin : séminaire des agents de prévention
  • Lundi 23 juin : répétition des soutenances de M2 - Binisha Shresta (M2, équipe ECCP) & Anita Viennet (M2, équipe EPLM).
  • Lundi 21 juillet : "From stopping cereal killers to protecting your smashed avocado toast"  -  Kar-Chun Tan (Curtin University, Australia) & “Understanding necrotrophic and non-host effector regulation in Parastagonospora nodorum” - Callum Verdonk (Curtin University, Australia)
Séminaires passés.
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20 mai 2025

Rédaction : FS

La diversité, levier majeur dans la régulation des bioagresseurs

L’expertise scientifique collective "RegulNat" portant sur la diversité végétale en tant que solution agroécologique pour la protection des cultures contre les bioagresseurs a impliqué des scientifiques de plusieurs unités INRAE, dont BIOGER, de 2021 à 2023. Un article de synthèse reprenant les principaux résultats de cette expertise a été publié dans la revue One Earth.
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10 mai 2025

Rédaction : FS

A la découverte des rouilles (Pucciniales) des Yvelines

La Journée Internationale de la Santé des Plantes, célébrée chaque 12 mai, est l'occasion cette année de mettre en lumière la parution d'un article à l'iconographie particulièrement fournie : "Contribution photographique à l'inventaire des Pucciniales (rouilles) autour des Clayes-sous-Bois". Ce second fascicule hors-série 2025 du Bulletin des Naturalistes des Yvelines témoigne des liens étroits entre Sciences participatives (botanistes/mycologues amatrices et amateurs) et Sciences plus académiques — ici la Phytopathologie, représentée par des chercheuses et chercheurs d'unités telles que BIOGER.

Angélique GAUTIER, Valérie LAVAL et Marie-Hélène BALESDENT ont développé un nouvel outil, la MPseqM combinant PCR multiplex et séquençage Illumina, pour caractériser les variants alléliques de huit gènes AvrLm dans les populations de L. maculans. Ce travail a fait l'objet d'un article publié dans BMC Microbiology.

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A l'occasion de sa soutenance d'Habilitation à Diriger des Recherches, Thierry Marcel a présenté ses travaux et perspectives de recherche sous le titre "Adaptation des champignons phytopathogènes à leurs environnements biotiques et abiotiques"

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Cet article publié dans la revue "Agricultural and Forest Meteorology" met en valeur des données aérobiologiques et épidémiologiques collectées par Frédéric Suffert, qui s’était intéressé en 1999 lors de son stage d’ingénieur agronome aux processus de dispersion par lesquels la pluie influence l’évolution de la concentration de spores de rouille de l'air au-dessus d’un couvert de blé. Il aura fallu attendre 25 ans, et un déménagement de Grignon à Saclay, pour prendre conscience de l’originalité des données et les analyser avec le recul nécessaire. Comme le dit l’adage, "c’est avec les vieux Burkards qu’on fait les meilleures soupes de spores" !

Les offres d'emploi et de stage

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21 mai 2025

Rédaction : FS

Offre de post-doc à BIOGER *** Pourvue ***

Un contrat postdoctoral de 10 mois est proposé en modélisation en épidémiologie végétale