Logiciels et outils en ligne

Logiciels BIOGER

Logiciel NanoDropOne viewer

Logiciel pour visualiser les dosages réalisés sur le NanoDropOne.

Pour installer le logiciel sur votre pc télécharger le fichier situé sur le pnas de l'unité : versailles-bioger (\\pnas1.stockage.inra.fr) > Unité > logiciel_nanodrop_one

Logiciel Image Lab

Logiciel pour visualiser les images des gels d'électrophorèse prises avec le chemidoc de Biorad en salle électrophorèse.

Pour installer le logiciel sur votre pc télécharger le fichier "Setup" situé sur le pnas de l'unité : versailles-bioger (\\pnas1.stockage.inra.fr) > Unité > logiciel_chemidoc_Biorad

Outils en ligne

Conversion

Conversion d'une masse de plasmide en moles et de moles en masse de plasmide avec le calculateur NEB.

Calcul d'une masse de plasmide et d'insert à mettre pour un ratio vecteur/insert donné avec le calculateur NEB.

Conversion de pmol en fmol avec ENDMEMO

Evaluation design primers

Sms2

Oligoevaluator de Sigma

Digestion

Trouver le bon tampon pour une double digestion : NEB, Thermofisher

Simuler un gel d'électrophorèse de digestion : ENDMEMO

Clonage

Design clonage HIFI et Gibson pour les kits de la marque NEB avec le NEBuilder assembly tool.

Génotypes et résistances des principales souches de E.coli  : openwetware

Choisir ses bactéries E.coli compétentes commerciales : arbre de décision ThermoFisher