Avancée méthodologique dans la caractérisation des populations de Zymoseptoria tritici

Suivre la fréquence de virulences au sein des populations de Zymoseptoria tritici, c’est-à-dire leur capacité à attaquer des variétés porteuses de gènes de résistance connus, est essentiel pour optimiser leur déploiement. L’enjeu est en effet d’utiliser des résistances efficaces tout en évitant que les populations pathogènes s’y adaptent trop rapidement, c’est-à-dire les « contournent ». Nous avons développé une méthode de « phénotypage en vrac » consistant à inoculer un micro-couvert de deux lignées de blé quasi-isogéniques - une portant un gène de résistance ciblé l'autre ne le portant pas - avec un mélange de plusieurs souches d'isolats représentatives d’une population à caractériser. La quantification du nombre de points d'infection (lésions) obtenus sur chaque plante permet ensuite, par approche différentielle, d’estimer la proportion de souches virulentes dans le mélange utilisé. En prenant pour cas d’étude Stb16q, un gène de résistance présent dans la variété de blé Cellule et contourné en Europe, nous avons établi que la corrélation entre le ratio du nombre moyen de lésions sur chaque ligne de blé et la fréquence des souches virulentes était relativement robuste. Cette méthode apparait donc comme un outil intéressant pour caractériser les populations de Z. tritici dans des contextes de déploiement de résistances variétales particuliers (choix variétal régionalisé, optimisation de mélanges variétaux, etc.) en complément des approches moléculaires en cours de développement à BIOGER.

Suffert F, Le Prieur S, Gélisse S, Dzialo E, Saintenac C, Marcel TC. 2024. Estimating the frequency of virulence against an Stb gene in Zymoseptoria tritici populations by bulk phenotyping on checkerboard microcanopies of wheat NILs. Plant pathology. https://doi.org/10.1111/ppa.13894

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