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Notre équipe étudie les processus adaptatifs et épidémiologiques des interactions entre le blé et ses champignons phytopathogènes. Nous caractérisons les déterminants et les conséquences de ces processus à différentes échelles. La finalité est de renforcer l'immunité du blé et de contrôler les sources d'inoculum, pour améliorer l'efficacité et la durabilité des stratégies de gestion des maladies, dans un contexte de changement climatique et de transition agroécologique. Notre principal modèle d'étude est Zymoseptoria tritici (septoriose) et, depuis peu, Puccinia graminis f. sp. tritici (rouille noire) considéré comme agent pathogène ré-émergent.

Les interactions entre les populations d'agent pathogènes et de leurs hôtes sont déterminées par la biologie et le mode de vie du champignon, par la pression sélective exercée par la plante (espèce et variété) et par différents facteurs abiotiques (conditions climatiques). Les processus impliqués dans les dynamiques adaptatives sont souvent spécifiques d'échelles temporelles (périodes intra- et inter-épidémiques) et spatiales (plante, champ, paysage). Ces considérations générales guident notre stratégie de recherche, qui repose sur quatre objectifs complémentaires :

1. Caractériser les processus responsables de la dynamique adaptative des populations de Z. tritici

2. Comprendre le déterminisme génétique et génomique de l'adaptation de Z. tritici et décrypter les mécanismes moléculaires de l'infection

3. Explorer le déterminisme et les conséquences épidémiologiques de la reproduction sexuée chez Z. tritici

4. Évaluer l'impact des interactions entre plantes cultivées et sauvages sur la balance bénéfice-risque de la diversification des cultures en système céréalier

Notre équipe est composée de trois scientifiques et de deux techniciennes, dont l'une partage ses activités en biologie moléculaire avec deux autres équipes. Nous bénéficions de l'appui de collaborateurs sous contrat (ingénieurs, chercheurs postdoctoraux) et de scientifiques en formation (doctorants et stagiaires de M1 ou M2). Nous sommes rattachés au LabEx SPS / OI C-BASC et affiliés aux écoles doctorales SEVE et ABIES.