Un dispositif expérimental pionnier et pérenne pour l’épidémiosurveillance de la résistance aux fongicides.

Cette base de données a été conçue pour pouvoir chaque année évaluer le statut de la résistance dans ces populations ainsi que la pression sélective associée aux différents programmes de traitement. L’ensemble de ces informations permet d’élaborer des recommandations de gestion de la résistance transmises aux acteurs de terrain par une note annuelle, dont nous sommes signataires. Cette note permet en particulier d’éviter les applications de fongicides rendus inefficaces par la résistance et de proposer des solutions alternatives à la lutte chimique. En plus d’être un outil pratique d’une grande valeur pour les agriculteurs, cette base de données unique en Europe, constitue également une ressource scientifique originale pour explorer la dynamique de l’adaptation sur de larges échelles de temps et d’espace. Lors de sa thèse, Maxime Garnault a réalisé une analyse statistique très approfondie de cette base de données et ainsi fourni une description quantitative de l’évolution de la résistance à plusieurs modes d’action fongicides dans les populations françaises de Z. tritici (Garnault et al, 2019). Il a également identifié les déterminants de l’évolution de la résistance à de larges échelles spatio-temporelles, quantifié leurs effets et en particulier mis en évidence que l’utilisation de fongicides à l’échelle régionale constituait le principal moteur de la dynamique des résistances (Garnault et al, 2021).  Par ailleurs, ce travail été complété par la création d’une application permettant de visualiser l’état des résistances sur une carte de France et de prévoir leur évolution. Enfin, les centaines d’échantillons rassemblés chaque année viennent enrichir nos collections historiques et constituent une précieuse source d’isolats originaux qui sont utilisés dans le cadre de nos projets explorant les mécanismes de résistance.

Références:
M. Garnault, C. Duplaix, P. Leroux, G. Couleaud, F. Carpentier, O. David, A‐S. Walker. Spatiotemporal dynamics of fungicide resistance in the wheat pathogen Zymoseptoria tritici in France. 2019. Pest Management Science, 75 (7), pp.1794-1807,⟨10.1002/ps.5360⟩.
M. Garnault, C. Duplaix, P. Leroux, G. Couleaud, O. David, A‐S. Walker, F. Carpentier. Large-scale study reveals regional fungicide applications as a major determinant of 2 resistance evolution in the wheat pathogen Zymoseptoria tritici in France. 2021. New Phytologist, 229 (6), pp.3508-3521, ⟨10.1111/nph.17107⟩.