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Présentation
Je suis épidémiologiste en santé végétale à INRAE. Ingénieur agronome de l'Institut Agro Rennes-Angers spécialisé en protection des cultures, j'ai un doctorat en phytopathologie et une HDR. Je travaille dans l'unité BIOGER sur le Campus Agro Paris-Saclay à Palaiseau. J'y co-anime l'équipe ADEP qui s'intéresse aux processus adaptatifs et épidémiologiques des interactions blé-champignons phytopathogènes. J'étudie les processus épidémiologiques impliqués dans le développement de la septoriose du blé, les déterminants et les conséquences de la reproduction sexuée de Zymoseptoria tritici (biologie fongique, écologie des résidus de culture source d'inoculum primaire, etc.), et la dynamique adaptative des populations pathogènes (profils de virulence et agressivité) dans des environnements hétérogènes (déploiement de résistances dans des associations variétales, fluctuations saisonnières de température et d'humidité, etc.). J'ai assuré plusieurs (co-)direction de thèses (ED ABIES) sur ces thématiques. Je m'intéresse également à l'impact des relations entre compartiments cultivés et sauvages (rôle des hôtes alternants et alternatifs, plantes de services vs. de disservices, etc.) sur la dynamique des maladies à cycle biologique complexe. J'ai initié en 2023 un programme de recherche sur l'épidémiologie de la rouille noire (Puccinia graminis f. sp. tritici), réémergente en Europe. Ancien auditeur de de l'IHEDN, j'aborde des problématiques de cindynique appliquées à l'épidémiosurveillance et la biosécurité des cultures (C&Aw). Je suis membre du CES Risques Biologiques pour la Santé des Végétaux de l'ANSES et participe à des travaux d'expertise pour INRAE (ex. ESCo RegulNat). Je suis membre de la cellule VSI de la plateforme d'Épidémiosurveillance en Santé Végétale (ESV), administrateur de la Société Française de Phytopathologie (SFP) et éditeur associé de la revue Journal of Plant Pathology. Je suis membre de l'Association des Naturalistes de Yvelines (ANY) et photographe de micromycètes (rouilles et oïdiums) que j'immortalise lors de "vad'rouilles".
Références
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• Gosme M, Suffert F, Jeuffroy MH. 2010. Intensive versus low-input cropping systems: What is the optimal partitioning of agricultural area in order to reduce pesticide use while maintaining productivity? Agricultural Systems 103: 110-116 http://dx.doi.org/10.1016/j.agsy.2009.11.002 [pdf]
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• Suffert F, Latxague E, Sache I. 2009. Plant pathogens as agroterrorist weapons: Assessment of the threat for European agriculture and forestry. Food Security 1: 221-232 http://dx.doi.org/10.1007/s12571-009-0014-2 [pdf]
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• Suffert F, Barbier M, Sache I, Latxague E. 2008. Biosécurité des cultures et agroterrorisme. Une menace, des questions scientifiques et une opportunité : réactiver un dispositif d’épidémiovigilance. Le Courrier de l'Environnement 56: 67-86 [pdf]
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• Latxague E, Sache I, Pinon J, Andrivon D, Barbier M, Suffert F. 2007. A methodology for assessing the risk posed by the deliberate and harmful use of plant pathogens in Europe. EPPO Bulletin 37: 427-435 http://dx.doi.org/10.1111/j.1365-2338.2007.01118.x [pdf]
• Desprez-Loustau ML, Robin C, Buée M, Courtecuisse R, Garbaye J, Suffert F, Sache I, Rizzo D. 2007. The fungal dimension of biological invasions. Trends in Ecology and Evolution 22: 472-480 http://dx.doi.org/10.1016/j.tree.2007.04.005 [pdf]
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• Suffert F. 2007. Kinetics modelling of the carrot cavity spot caused by a complex of pathogens of the genus Pythium dominated by Pythium violae. Canadian Journal of Plant Pathology 29: 41-55 http://dx.doi.org/10.1080/07060660709507436 [pdf]
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• Suffert F. 2005. A theoretical approach to the 'complementation' notion concerning strategies of crop protection. Phytoprotection 86: 89-92 http://dx.doi.org/10.7202/012509ar [pdf]
2003
• Suffert F. 2003. L'utilisation volontaire d'agents phytopathogènes contre les cultures. Phytoma 563: 8-12 [pdf]
2002
• Suffert F. 2002. L'épidémiologie végétale, nouvelle discipline de guerre ? Lumière sur le bioterrorisme agricole, un enjeu émergent pour la recherche agronomique. Le Courrier de l'Environnement 47: 57-69 [pdf]
2000
• Suffert F, Sache I, Huber L. 2000. Effets de divers types de pluie sur la dispersion de spores de rouille jaune (Puccinia striiformis) et de rouille brune (Puccinia recondita f. sp. tritici) sur blé. Annales de la 6e Conférence Internationale sur les Maladies des Plantes, 6-8 décembre 2000, Tours, France [pdf]
Encadrement de thèses
• Alicia Culot (2024-... ; co-directeur) "Analyse et gestion d’un risque épidémique réémergeant en santé végétale : survie, dispersion et récurrence de la rouille noire du blé, à l’interface entre compartiments cultivé et naturel" (ED ABIES)
• Chloé Papin (2023-... ; directeur) "Caractériser l’impact d’associations de variétés de blé sur l’évolution de la structure de virulences d’une population de Zymoseptoria tritici" (ED ABIES)
• Cécilia Fontyn (2018-2022 ; directeur) "L’agressivité est-elle une composante significative de l’adaptation au paysage variétal cultivé des populations de Puccinia triticina, agent de la rouille brune du blé ?" (ED ABIES) [résumé & pdf] [publications #1, #2, #3] [prix Phloème 2022]
• Carolina Orellana-Torrejon (2018-2022 ; co-directeur) "Impact d’associations variétales de blé tendre sur la dynamique annuelle d’adaptation d’une population de Zymoseptoria tritici à un gène de résistance qualitative récemment contourné" (ED ABIES) [résumé & pdf] [publications #1, #2, #3] [prix BSPP 2022]
• Safa Ben Krima (2017-2020 ; co-encadrant) "Adaptation des champignons phytopathogènes à des peuplements génétiquement hétérogènes : cas du pathosystème blé dur-Zymoseptoria tritici" (ED SEVE) [résumé] [publication #1]
• Anne-Lise Boixel (2015-2020 ; co-directeur) "L’hétérogénéité environnementale, un moteur de l’adaptation à la température des populations d’agents phytopathogènes foliaires ?" (ED ABIES) [résumé & pdf] [publications #1, #2] [médaille d’argent Dufrenoy de l’Académie d'Agriculture]
• Lydie Kerdraon (2015-2019 ; directeur) "Diversité microbienne et interactions pathogène-microbiome dans les résidus de culture : le cas de Zymoseptoria tritici et Leptosphaeria maculans en système blé-colza" (ED ABIES) [résumé & pdf] [publications #1, #2, #3, #4, #5]
• David Morais (2011-2015 ; co-encadrant) "Les déterminants des phases épidémiques précoces de la septoriose du blé (Zymoseptoria tritici) : quantité, efficacité et origine de l'inoculum primaire" (ED ABIES) [résumé & pdf] [publications #1, #2, #3, #4]
• Frédéric Bernard (2009-2012 ; co-encadrant) "Le développement d'un champignon pathogène foliaire réagit à la température. Mais à quelle température ?" (ED ABIES) [résumé & pdf] [publications #1, #2]
Projets
• MOBIDIV (PPR ANR 2021-2026). Mobiliser et sélectionner la diversité cultivée intra et inter-spécifique pour un changement systémique vers une agriculture sans pesticide | Détails
• COMBINE (ANR 2023-2027). Associer plusieurs variétés pour contrôler les populations d'agents phytopathogènes : Comment résoudre le compromis efficacité / durabilité / technicité et coût-efficacité ? | Détails
• DURABLASSO (Thèse CIFRE ARVALIS 2023-2026). Caractériser l’impact d’associations de variétés de blé sur l’évolution de la structure de virulences d’une population de Zymoseptoria tritici.
• WHEATSECURITY (ERA-NET SusCrop UE 2023-2026). Identification et déploiement durable de la diversité génétique du blé pour renforcer la résilience et la sécurité de l'approvisionnement alimentaire européen | Détails
• MYCOMIX (SPE INRAE 2024-2026 et BIOSPHERA transverse 2024-2025). Les associations variétales influencent-elles la composition et la structure des communautés fongiques de la phyllosphère et de la résidusphère ?
• MICROBIAL RENDEZ-VOUS (INRAE-CSIRO linkage proposal 2024). Les résidus de culture, lieu de rencontre inexploré pour les agents phytopathogènes: opportunités pour le développement de nouvelles stratégies de gestion durable des maladies.
• SEED (Métaprogramme INRAE SuMCrop 2021-2022). Incidence de la gestion des semences de blé dur par les agriculteurs tunisiens sur la durabilité du contrôle des maladies.
• TREMÄ (Métaprogramme INRAE SuMCrop 2024-2025). Consortium et séminaire tuniso-français sur les résistances aux maladies en grandes cultures.
• PROFAS (France-Algérie 2023-2024). Valorisation des blés sahariens et des savoir-faire afférents.
• BLADE2025 (IVD4 2021-2025). Blés pour une agriculture durable et écologique.
• BASTAFUN (SPE INRAE 2023-2025). Base génomique de l'adaptation multi-stress chez un champignon phytopathogène.
• PHECOLLPHYT 1 et 2 (Aviv MNHN 2021-2022 et prématuration Alliance Sorbonne Université SATT Lutech 2023-2025). Utilisation des phéromones de collemboles pour le contrôle des champignons phytopathogènes dans les cultures de blé.
• RUSTWATCH (H2020 UE 2018-2022). Système européen d'alerte rapide pour les rouilles du blé | Détails
• ROUILLENOIRE_2.0 (FSOV 2024-2026). Anticiper la réémergence de la rouille noire du blé en France en couplant épidémiosurveillance et caractérisation de matériel végétal.
• MYCORE (OI BASC Paris-Saclay, 2022-2023). Myco-contrôle de la renouée faux liseron par une rouille présente naturellement dans l'environnement.
