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BIOGER

L'unité de recherche BIOGER (BIOlogie des champignons phytopathogènes : des GEnomes aux agRo-écosystèmes) de l'INRAE est un pôle de référence français pour la recherche sur les maladies fongiques des grandes cultures en Europe (blé, colza et, dans une moindre mesure, vigne).

BIOGER fait partie du Centre INRAE Versailles-Saclay et, depuis octobre 2022, elle se situe sur le Campus Agro Paris-Saclay. L'unité est rattachée au département INRAE Santé des Plantes et Environnement (SPE) (intranet SPE ici >>>).

BIOGER développe des approches pluridisciplinaires (génomique, biologie moléculaire et biochimie, biologie cellulaire, génétique, génétique des populations, évolution, épidémiologie, modélisation, phénotypage, diagnostic et taxonomie) et multi-échelles (du gène au paysage).
Nos modèles d'étude sont des agents pathogènes responsables de maladies fongiques d'importance économique majeure. Ils comprennent les rouilles du blé (Puccinia striiformis et Puccinia triticina), Zymoseptoria tritici (septoriose du blé), Leptosphaeria maculans (nécrose du collet du colza), et des agents pathogènes généralistes que sont Botrytis cinerea (pourriture grise) et des espèces de Colletotrichum (anthracnose).
Les travaux de BIOGER et de nos collaborateurs ont contribué à élever ces espèces fongiques au rang de modèles pour certains aspects de leurs traits génomiques, biologiques, écologiques ou adaptatifs.

Nos travaux s'articulent autour de quatre grands thèmes de recherche intégrés :
1. Biologie et modes de vie des champignons pathogènes
2. Mécanismes d'interactions au sein de l'écosystème de la plante hôte
3. Adaptation des champignons phytopathogènes
4. Gestion durable des maladies fongiques

Ces thèmes sont développés par cinq équipes de recherche, avec l’appui de deux plateformes techniques et des services communs :

ADEP – Processus adaptatifs et épidémiologiques des interactions blé-champignons phytopathogènes
BioSysCo – Biologie des Populations dans les Systemes sous contraintes
ECCP – Effectors of Communication at the fungal Plant interface
EPLM – Effecteurs et Pathogenèse chez Leptosphaeria maculans
GAIA – Gestion et Anticipation Intégrées de l’Adaptation des champignons phytopathogènes

Plateformes techniques : BioInfoBIOGER, IMAFUN

Services communs : Administration , Service informatique, Laverie, Serres

Nos recherches, à la fois fondamentales et appliquées, ont donc pour objectif global de répondre aux attentes sociétales en termes de lutte durable et respectueuse de l'environnement contre les maladies fongiques des plantes de grande culture et de gestion des risques liés à la dissémination et au potentiel adaptatif des champignons phytopathogènes.

Agenda des séminaires

Sauf mention contraire, les séminaires ont lieu le lundi à 13h45 en salle F3.506.

  • Lundi 27 janvier : "Wheat stem rust back in France ?" - Kevin Meyer (équipe ADEP, BIOGER)
Séminaires passés:
  • Lundi 20 janvier : " Survival and recurrence of Puccinia graminis (black stem rust) in France" - Alicia Culot (étudiant 1ère année de thèse, équipe ADEP, BIOGER)
  • Lundi 13 janvier : "Bread and durum wheat adaptation in Zymoseptoria tritici "- Ulysse Guilloteau (étudiant 1ère année de thèse, équipe ADEP, BIOGER)
  • Lundi 6 janvier : "An inversion polymorphism under balancing selection in the invasive chestnut blight fungal pathogen Cryphonectria parasitica" - Fanny Hartmann (ESE, IDEEV)
Physical position of the 57 QTL detected in this study and the major Stb genes reported in the literature on the 21 wheat chromosomes from the Chinese Spring RefSeq v2.1.
article

22 janvier 2025

Rédaction : AD - TM

Architecture génétique de la résistance à la septoriose dans les variétés de blé tendre françaises

L'équipe ADEP publie dans BMC Plant Biology le résultat d'un travail de longue haleine débuté dans le cadre du projet ANR BreedWheat (2011-2019) et poursuivi avec le projet FSOV DivR (2019-2021) en collaboration avec l'UMR GDEC.
article

22 janvier 2025

Rédaction : AD

Prévalence en Europe d'allèles de résistances aux IDM et SHI chez Z. tritici

Avec ses collègues de 8 autres pays européens, Anne-Sophie Walker (BIOGER) a participé à l'évaluation de la prévalence des principaux allèles de résistance associés à la résistance aux fongicides DMI et SDHI dans les populations européennes de Zymoseptoria tritici en 2022.

Mise à jour de la base MIBiG par un consortium international de 288 scientifiques. Jean-Félix DALLERY (BIOGER) a participé à l'annotation et la curation des métabolites secondaires fongiques.

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Toutes nos félicitations à Cécilia Fontyn qui a été distinguée par le prix "Young Plant Pathologist" pour le dernier article issu de sa thèse paru dans la section "Fresh Ideas in Plant Health" de la revue Journal of Plant Pathology.

Accueil de Tara LAGARDE et Antoine MALET de septembre 2024 à janvier 2026

Les offres d'emploi et de stage

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14 janvier 2025

Rédaction : BIOGER

Dynamics of adaptation and genome evolution in fungal populations

Open position for a Post-doctoral researcher in Population Genomics